Количество гуаниловых нуклеотидов в ДНК важно для её стабильности, потому что они образуют большее количество водородных связей, чем другие пары оснований. 13

АТ связаны двумя, а ГЦ — тремя водородными связями, поэтому на разрыв ГЦ требуется больше энергии. 1 Процент ГЦ-пар и длина молекулы ДНК определяют количество энергии, необходимой для диссоциации цепей: длинные молекулы ДНК с большим содержанием ГЦ более тугоплавки. 1

Кроме того, последовательности с высоким содержанием гуанина стабилизируют концы хромосом, формируя G-квадруплексы — структуры, состоящие из четырёх, а не двух взаимодействующих оснований. 1 Четыре гуаниновых основания, все атомы которых находятся в одной плоскости, образуют пластинку, стабилизированную водородными связями между основаниями и хелатированием в центре неё иона металла (чаще всего калия). 1