Коэффициент детерминации может быть бесполезным инструментом для сравнения моделей по нескольким причинам:

• Некорректность сравнения моделей с разным числом переменных. 34 Значение коэффициента детерминации увеличивается при добавлении в модель новых переменных, даже если они никак не связаны с зависимой переменной. 3
• Невозможность оценить точность прогнозов. 2 Коэффициент детерминации показывает, насколько хорошо модель описывает данные, но не гарантирует точность прогнозов. 2 В некоторых случаях излишнее точное описание приводит к ухудшению прогнозных свойств модели. 2
• Отсутствие причинно-следственной связи. 1 Высокие значения коэффициента детерминации ещё не говорят о причинно-следственной связи между переменными. 1
• Необходимость дополнительных исследований. 5 Применение коэффициента детерминации для оценки качества модели и выбора наилучшей без дополнительных исследований, направленных на доказательство того, что модель подобрана правильно, необоснованно. 5

Чтобы преодолеть эти проблемы, используют скорректированный коэффициент детерминации, который позволяет сравнивать модели с разным числом переменных и накладывает штраф за дополнительно включённые в модель переменные. 13