Клеточное дыхание может происходить в отсутствие кислорода, потому что гликолиз, основной этап этого процесса, является полностью анаэробным и для его осуществления не требуется присутствия кислорода. 5

При отсутствии кислорода дальнейшая обработка пирувата осуществляется путём ферментации. 1 Например, при молочнокислом брожении пируват превращается в молочную кислоту, а при алкогольном брожении — в этанол и диоксид углерода. 1

Также в электронтранспортной цепи вместо кислорода может использоваться другой конечный акцептор (трёхвалентное железо, нитрат- или сульфат-анион). 5

При наличии кислорода происходит аэробное дыхание, которое является более эффективным механизмом, производящим больше АТФ. 1