Кэп важен для жизненного цикла эукариотической мРНК, поскольку выполняет несколько функций, среди которых:

• Защита от деградации. 13 Присутствие кэпа на 5'-конце предотвращает быстрое разрушение молекул мРНК под действием экзонуклеаз. 13
• Участие в транспорте РНК. 1 Кэп играет важную роль в экспорте мРНК из ядра. 1
• Стимуляция трансляции. 1 Кэп необходим для начала синтеза белка, так как без него рибосома не может связаться с мРНК. 5
• Регуляция транскрипции. 1 Кэпирующие ферменты могут играть роль в этом процессе, что важно, например, для генов, отвечающих за эмбриональное развитие и ответ клетки на внешние воздействия. 1
• Участие в процессинге 3'-конца мРНК. 1 Наличие кэпа стимулирует расщепление 3'-конца мРНК. 1

Таким образом, кэп способствует эффективному процессингу пре-мРНК, что важно для стабильности и функционирования мРНК в клетке эукариот. 13