Карликовые крокодилы питаются в основном беспозвоночными из-за особенностей среды обитания и доступности пищи. 24

В сезон дождей, когда половодье приносит обилие рыбы, в рационе крокодилов преобладает рыба. 2 В засушливые месяцы, когда рыба менее доступна, в меню появляются раки, лягушки, моллюски и падаль. 2

Кроме того, благодаря небольшому размеру карликовые крокодилы более маневренны и ловки при охоте, что позволяет им ловить мелкую добычу, такую как насекомые. 13