Долгое время каракала считали подвидом рыси, потому что он внешне на неё похож. 13 В частности, у них одинаковые длинные заострённые уши с кисточками на концах. 3

Однако позднее более детальные исследования выявили существенные генетические различия между этими видами, и каракала выделили в отдельный род. 2 Выяснилось, что он отделился от общего предка примерно на миллион лет раньше, чем рыси, и развивался самостоятельно. 2

Ближайшие родственники каракала — не рыси, а сервалы и африканские золотые кошки. 2

В отличие от каракалов, рыси несколько крупнее и массивнее, отличаются окрасом, рисунком, структурой шерсти и некоторыми другими анатомическими особенностями. 2