Кандык сибирский считается реликтовым растением в Сибири, потому что является гемиэндемичным видом третичного возраста. 23
Кандык — одно из самых раноцветущих растений, зацветает сразу после стаивания снега. 23 В равнинных районах Южной Сибири этот период начинается с середины апреля и продолжается до середины мая (в зависимости от региона и времени таяния снега). 23
При этом кандык — уязвимый реликтовый вид, его популяция сокращается. 3 Основные факторы, угрожающие существованию растения, — уничтожение естественных мест обитания и сбор населением для продажи как ранневесеннего декоративного растения или в пищевых целях. 23
Кандык сибирский внесён в «Красную книгу России» (1988, 2008) и большинство региональных «Красных книг», где встречается этот вид. 34