Изучение микробной биогеографии важно для сохранения биоразнообразия, потому что позволяет:

• Понимать основные механизмы, которые создают биоразнообразие и препятствуют ему. 1 Это необходимо для эффективного управления ресурсами и сохранения экосистем. 5
• Предсказывать, где определённые организмы могут выжить и как они реагируют на изменение окружающей среды. 1 Это делает микробную биогеографию применимой в ряде других областей, например, исследований изменения климата. 1
• Определять «горячие точки» биоразнообразия. 2 С помощью ключевых метрик микробного биоразнообразия и угроз природоохранные организации могут выявить участки, которые имеют решающее значение для сохранения. 2
• Разрабатывать методы сохранения биоразнообразия. 5 Это включает в себя создание заповедников и охраняемых территорий, разработку программ по восстановлению и управлению видами, научное разведывание для нахождения новых видов и их местообитаний, а также разработку методов устойчивого использования природных ресурсов. 5