Избыточное внесение удобрений считается негативным антропогенным фактором по нескольким причинам:

• Загрязнение водных ресурсов. 1 При поливе полей или дождевых стоках удобрения могут попадать в реки, озёра и подземные воды. 1 Это приводит к повышению содержания нитратов и фосфатов в воде, что вызывает проблемы для водных организмов. 1
• Ухудшение структуры почвы. 2 Избыток минеральных удобрений приводит к уплотнению, снижению пористости почвы, уменьшению доли зернистых агрегатов, подкислению. 2 Из коллоидных комочков, удерживающих воду, воздух и питательные элементы, почва превращается в пылеобразное вещество. 2
• Угроза биоразнообразию. 1 Высокие концентрации питательных веществ в почве и воде могут способствовать росту определённых видов растений, что приводит к снижению разнообразия растительного покрова и вытеснению других видов. 1
• Выбросы парниковых газов. 1 Производство химических удобрений требует большого количества энергии, что может приводить к выбросам парниковых газов, таких как углекислый газ и оксид азота. 1
• Изменение видового состава микроорганизмов почвы. 2 Применение минеральных удобрений ведёт к изменению видового состава микроорганизмов почвы, которые являются одним из главных звеньев в формировании плодородного слоя и развитии растений. 2