Капиллярный электрофорез используют для разделения белков по следующим причинам:

• Высокая разрешающая способность. 1 В основе метода лежат электрокинетические явления — электромиграция заряженных частиц и электроосмос. 1 Параметры электромиграции специфичны для каждого сорта заряженных частиц, что позволяет разделять пробу на индивидуальные компоненты. 1
• Ослабление возмущающих факторов. 1 В капилляре существенно ослаблены диффузионные, сорбционные, конвекционные, гравитационные факторы, благодаря чему достигаются рекордные эффективности разделений. 1
• Полная автоматизация процесса. 15 По сравнению с традиционными анализами белков в полиакриламидном геле, варианты капиллярного электрофореза обладают такими преимуществами, как отсутствие стадии окрашивания, низкая стоимость одного определения и короткое время анализа. 5