Искусственные экосистемы не могут полностью заменить природные биогеоценозы, потому что они отличаются от них по ряду признаков: 2

• Источники энергии. 2 Природные экосистемы получают энергию только от солнца, а в искусственных человек использует дополнительные источники энергии для внесения удобрений, рыхления почвы, борьбы с сорняками и т. п.. 2
• Видовое разнообразие. 2 В искусственных экосистемах, например агроценозах, сильно снижено видовое разнообразие организмов. 2 Это следствие искусственного отбора, проводимого человеком: он размножает высокоурожайные сорта определённых видов и борется с нежелательными видами. 2
• Круговорот веществ. 24 В природном биогеоценозе происходит замкнутый круговорот веществ, а из агроценозов человек регулярно изымает часть вещества в виде сельскохозяйственной продукции. 2 Это приводит к необходимости вносить удобрения для компенсации забранных веществ. 2
• Устойчивость. 24 Искусственные экосистемы не способны к саморегуляции и самовозобновлению, подвержены угрозе гибели при массовом размножении вредителей или возбудителей болезней. 2

Таким образом, природные экосистемы, которые могут выживать без вмешательства человека, обладают высокой устойчивостью и способностью адаптироваться к изменениям в окружающей среде и эволюционировать, в то время как искусственные экосистемы, созданные человеком, часто становятся менее устойчивыми и более восприимчивыми к изменениям окружающей среды. 1