Инфузории считаются важными элементами водных экосистем, потому что они играют ключевую роль в цепях питания. 1 Они потребляют детрит, бактерий, других простейших, одноклеточные водоросли, а сами являются пищей для водных беспозвоночных и мальков рыб. 1

Кроме того, инфузории являются движущими силами биогеохимического круговорота азота, углерода и других элементов. 2 Они выступают связующим звеном в потоке энергии в водных системах, связывая первичную продукцию с более высокими трофическими уровнями. 2

Также инфузории регулируют численность одноклеточных водорослей и бактерий, обитающих в воде. 3 По количеству инфузорий можно определить, насколько грязная вода в водоёме. 3