Хвощевидные растения исчезли с лица Земли из-за изменения климата: в конце каменноугольного периода климат стал холоднее и суше, что сделало невозможным размножение споровых растений, к которым относятся хвощи. 1
На смену им пришли голосеменные представители флоры, которым для размножения не нужна вода. 1
Кроме того, вымиранию хвощевидных растений способствовало появление более совершенных организмов, у которых появились настоящие органы (корень, стебель, ствол, листья), более простой и надёжный способ размножения и защищённость наследственного материала. 3