Почему хомяки так сильно отличаются размерами щек в разных подвидах?

Возможно, имелись в виду различия в размерах защёчных мешков у разных хомяков. Эта особенность связана с тем, что щёки (защёчные мешки) нужны хомякам для переноса корма и создания запасов. school-science.ru school-journal.ru

В зависимости от вида, защёчные мешки могут переносить за один раз массу корма, равную 1/4–1/2 массы тела животного. school-science.ru

Кроме того, хомяки используют набитые щёки для других целей: переносить материалы для гнезда или даже пугать врагов. dzen.ru

Таким образом, различия в размерах щёк разных хомяков обусловлены их природным инстинктом запасать пищу и необходимостью переносить большие объёмы корма.