Хлоропласты имеют собственную кольцевую ДНК в результате происхождения путём симбиогенеза. 45

По этой теории, хлоропласты возникли из цианобактерий, превратившись во внутриклеточную структуру. 14 Такой симбиоз оказался удобным как для клеток-«гостей», так и для клеток-«хозяев». 1 Генетический аппарат клетки взял на себя синтез части белков, необходимых хлоропластам, а они, в свою очередь, поставляют «хозяев» энергией для биосинтетических процессов. 1

Собственная кольцевая ДНК хлоропластов находится в строме, которая является аналогом матрикса митохондрий и содержит большое количество ферментов. 1