Хемосинтезирующие водоросли играют важную роль в морских экосистемах по нескольким причинам:

• Обеспечение питания для обитателей глубин. 2 Хемосинтезирующие организмы могут жить в океанах на большой глубине, где нет солнечного света. 35 Они образуют новое органическое вещество за счёт химических реакций, например окисления аммиака, водорода, соединений серы, закисного железа. 2
• Участие в круговороте элементов. 13 Хемосинтезирующие водоросли участвуют в обмене важнейших для жизни элементов: серы, азота, железа и других. 13
• Очистка окружающей среды. 15 Хемосинтезирующие организмы способны уничтожать ядовитые вещества, такие как аммиак и сероводород, и таким образом работать как очистители. 15
• Поддержка популяций животных. 3 За счёт хемосинтезирующих бактерий и архей могут поддерживаться большие популяции животных в определённых местах океана, например в белых и чёрных курильщиках, метановых клатратах, холодных просачиваниях. 3

Таким образом, хемосинтезирующие водоросли обеспечивают функционирование морских экосистем, обеспечивая питание для обитателей глубин и участвуя в круговороте необходимых элементов.