Грибы и бактерии считаются важнейшими участниками биогеохимических циклов в природе, потому что они катализируют химические реакции, необходимые для преобразования элементов из одной формы в другую. 1 Это позволяет поддерживать баланс веществ в экосистемах. 1

Некоторые примеры участия микроорганизмов в биогеохимических циклах:

• Углеродный цикл. 15 Фотосинтезирующие бактерии и цианобактерии преобразуют углекислый газ в органические соединения, а сапрофитные бактерии разрушают эти соединения, возвращая углерод в атмосферу в виде CO₂. 1
• Азотный цикл. 15 Азотфиксирующие бактерии преобразуют атмосферный азот в аммоний, который затем используется растениями. 1 Нитрифицирующие бактерии превращают аммоний в нитриты и нитраты, а денитрифицирующие бактерии возвращают азот в атмосферу, завершая цикл. 1
• Серный цикл. 5 Бактерии сульфатредукторы превращают сульфаты в сероводород, в то время как другие группы микроорганизмов окисляют сероводород обратно к сульфатам или оседают его в виде элементарной серы. 5
• Фосфорный цикл. 5 Микроорганизмы участвуют в освобождении фосфора из минеральных и органических соединений и его инкорпорации в биологические молекулы. 5