Гребенчатый тритон считается редким видом в Московской области по нескольким причинам:

• Разрушение мест обитания и размножения. 1 Это происходит из-за хозяйственной деятельности и чрезмерной рекреационной нагрузки. 3
• Химическое загрязнение водоёмов. 3 Гребенчатый тритон чувствителен к качеству воды и негативно реагирует на повышение кислотности. 3
• Угроза от хищных рыб. 2 Личинки тритона уязвимы для хищных рыб, например ротана-головёшки, интродукция которого в Московскую область привела к сокращению местных популяций гребенчатого тритона. 2
• Преследование и вылов человеком. 1 Это особенно опасно для животных, численность популяций которых изначально невысока. 1

Гребенчатый тритон занесён в Красную книгу Московской области. 4