Горизонтальный перенос генов стал важен для эволюционных процессов, потому что он может приводить к эволюционным изменениям в организме. 1 Новые гены могут добавлять новые функции и свойства, а также сделать организмы устойчивыми к антибиотикам и другим факторам среды. 1

Для простейших форм жизни горизонтальный перенос генов становится важнейшим фактором, определяющим их эволюцию. 1 Вследствие этого границы между видами как генетически обособленными популяциями стираются, и более стабильной эволюционной единицей становится не отдельный вид, а квазивид — набор нескольких линий, генетически взаимодействующих и поддерживающих друг друга. 1

Кроме того, благодаря горизонтальному переносу генов любое «удачное изобретение» одного из видов становится доступным и может быть заимствовано всеми остальными. 3