Гликоген накапливается преимущественно в клетках печени и мышц, потому что эти органы выполняют разные функции в отношении гликогена. 15

В клетках печени гликоген служит основным резервом углеводов в организме. 2 При понижении уровня глюкозы, например, между приёмами пищи, печень отдаёт часть гликогена, и происходит обратный процесс расщепления — гликогенолиз. 1 Цепочки молекул распадаются на глюкозу, которая поступает в кровь и становится доступной для клеток всех органов. 1

В мышцах гликоген расходуется на поддержку самих мышц во время нагрузок. 1 В отличие от печени, мускулы не могут поделиться глюкозой с другими органами — она расходуется локально, на нужды конкретной мышечной группы. 1