Различие в написании глаголов «вырубить» и «вырубишь» связано с разными окончаниями:
Это объясняется правилом о спряжении глаголов: глаголы II спряжения имеют окончания «-у (-ю), -ишь, -ит, -им, -ите, -ат (-ят)», а глаголы I спряжения — окончания «-у (-ю), -ешь (-ёшь), -ет (-ёт), -ем (-ём), -ете (-ёте), -ут (-ют)». 2
«Вырубишь» относится ко II спряжению (начальная форма — вырубить), поэтому в окончании пишется буква «и». 23