Гидрофобные аминокислоты стремятся сгруппироваться в центральной части белковой глобулы, потому что их контакт с водой крайне невыгоден с энергетической точки зрения. 4

Если в полипептидной цепи содержится много гидрофобных групп, то в водной среде эта цепь стремится свернуться таким образом, чтобы гидрофобные группы сблизились возможно теснее, вытолкнув воду. 1 При этом гидрофобные группы аминокислот бывают обращены внутрь, к центру молекулы, а гидрофильные группы — наружу, к водной среде, что делает белок растворимым. 1

Также при формировании третичной структуры белка все гидрофобные части погружаются внутрь молекулы, а на поверхности ориентируются гидрофильные группировки, обеспечивающие взаимодействие белковой молекулы с молекулами воды. 2