Гетерохроматин и эухроматин играют важную роль в функционировании клетки, потому что выполняют разные функции:

• Эухроматин обеспечивает активную транскрипцию генов. 1 Развёрнутая структура эухроматина позволяет белкам генной регуляции и комплексам РНК-полимеразы связываться с последовательностью ДНК, что инициирует процесс транскрипции. 1 Поэтому существует прямая связь между тем, насколько активно продуктивна клетка, и количеством эухроматина в её ядре. 1
• Гетерохроматин помогает поддерживать стабильность генома. 2 Он способствует сохранению формы хромосом, подавляет экспрессию повторяющихся элементов и регулирует структуру клеток при росте и дифференцировке. 2