Гематоксилин окрашивает ядра в синий цвет, вероятно, из-за взаимодействия с амино- и гуанидино-группами ДНК в ядре. 1
Гематоксилин сам по себе не обладает красящими способностями, эту способность он приобретает после окисления в гематеин, соединения которого с ионами металлов (алюминия, железа, меди, хрома, молибдена, ванадия) дают окрашенные вещества. 23
Процесс окисления гематоксилина в гематеин занимает несколько недель и называется «созреванием». 3 Для ускорения процесса в красящие растворы вводят сильные окислители, в роли которых могут выступать перекись водорода, перманганат калия и другие соединения. 34