Гаплоидные организмы более уязвимы к генетическим мутациям, потому что в них все рецессивные гены проявляются в фенотипе. 5 В диплоидных организмах же большинство новых мутаций фенотипически не проявляется, поскольку они рецессивны. 12 Это позволяет им длительное время сохраняться у особей вида в гетерозиготном состоянии без вреда для организма и проявиться в будущем при переходе в гомозиготное состояние. 1

Кроме того, гаплоидные организмы имеют по одной хромосоме каждой гомологичной пары, что также способствует возникновению геномных мутаций, например, при нарушении расхождения хромосом при клеточном делении. 5

Таким образом, диплоидные организмы обеспечивают буфер против пагубного воздействия мутаций, в то время как гаплоидные организмы более подвержены их прямому проявлению в фенотипе.