Галапагосский баклан остался нелетающим в процессе эволюции из-за мутаций в нескольких генах. 23 Они привели к неправильной работе первичных ресничек (цилий), из-за чего скелет птицы стал развиваться неправильно, в том числе укоротились крылья. 23

Также считается, что бакланы утратили способность к полёту, так как на Галапагосских островах не было естественных врагов и необходимости в сезонных миграциях. 24 Вместо этого птицы выбрали другие способы передвижений: ходьбу и плавание. 1 При этом из-за укороченных крыльев уменьшилась плавучесть бакланов, что сделало их проще нырять и охотиться за рыбой. 4