Некоторые причины вымирания галапагосских черепах на одноимённых островах:

• Браконьерство. 3 Китобои, пираты, рыбаки и другие мореплаватели истребляли черепах, потому что это была легкодоступная пища. 4
• Уничтожение мест обитания для нужд сельского хозяйства. 15 Многие пляжи были уничтожены построенными на них отелями. 1
• Ввоз и распространение чужеродных животных на островах, таких как крысы, козы и свиньи. 15 Они стали конкурировать с черепахами за корм, уничтожая значительную часть растительности. 14

В 1960-х годах на острове Эспаньола (входит в состав Галапагосских островов) оставалось лишь 15 галапагосских черепах. 5 Для спасения популяции была проведена долгосрочная программа репатриации: черепах, находившихся в неволе в разных странах мира, партиями возвращали на родину. 5

В настоящее время галапагосские черепахи находятся под угрозой исчезновения из-за изменения климата, в частности из-за потепления океана. 23 Это влияет на источники пищи животных: черепахам трудно создавать гнезда при более высоких температурах, а количество доступной пищи уменьшается. 23