Несколько причин, по которым функция setTimeout может выполняться дольше ожидаемого времени:

• Исполнение функции занимает больше времени, чем задержка. 1 Например, если функция сложная, а задержка маленькая, или если она содержит операторы alert, confirm или prompt, которые блокируют поток выполнения. 1
• Таймер в браузере замедляется. 3 Это может происходить по разным причинам, например: перегружен процессор, вкладка браузера в фоновом режиме, работа ноутбука от аккумулятора. 3 Всё это может увеличивать минимальный интервал срабатывания таймера (и минимальную задержку) до 300 или даже 1000 миллисекунд в зависимости от браузера и настроек производительности ОС. 3
• Если вкладка не активна продолжительное время, современные браузеры замедляют или даже прекращают выполнение JavaScript, в этом случае работа setTimeout может быть существенно замедлена или даже приостановлена. 2