Фрэнсис Бэкон критиковал использование силлогизма в научных исследованиях по нескольким причинам:

• Неприменимость к принципам знаний. 2 Бэкон считал, что силлогизм может вывести только то, что уже содержится в исходных посылках, а получить новые принципы с его помощью нельзя. 2
• Оперирование мнениями, а не реальными предметами. 1 Силлогизм, по мнению Бэкона, подчиняет себе мнения, а не предметы, что делает его бесполезным для истинного познания. 13
• Поспешность. 25 Бэкон называл силлогистический метод «предвосхищением природы» и указывал на его поспешность. 2 Он предлагал более надёжный и истинный метод, который, по его мнению, должен быть поэтапным и достаточно медленным. 2
• Неясность используемого языка. 2 Бэкон считал, что если понятия, которые составляют основу всего, спутаны и необдуманно отвлечены от вещей, то нет ничего прочного в том, что построено на них. 23