Почему формат VCF стал стандартом для хранения генетических данных?

Формат VCF стал стандартом для хранения генетических данных по нескольким причинам:

• Универсальность. 5 VCF позволяет представлять широкий спектр генетических вариантов, выявленных с помощью секвенирования ДНК. 5 К ним относятся SNP-варианты, вставки, делеции и структурные варианты. 5
• Стандартизированный обмен данными. 5 VCF служит форматом для обмена информацией о вариантах между разными биоинформатическими инструментами, платформами и исследовательскими группами. 5 Это важно для сотрудничества и воспроизводимости генетических исследований. 5
• Гибкость. 23 Структура VCF позволяет гибко настраивать данные, представленные в файле, что помогает собирать наиболее точные данные и метаданные. 2
• Надёжность. 1 Требования к типу и количеству переменных в VCF уменьшают количество ошибок синтаксического анализа и недостающих данных, предотвращая непредвиденную работу программы. 1

Кроме того, VCF был разработан в рамках проекта 1000 Genomes, что сделало его стандартом из-за краткости формата и увеличения объёма данных, генерируемых методами секвенирования следующего поколения (NGS). 2