Эстуарии важны для морских экосистем по следующим причинам:

• Они являются высокопродуктивными водными местообитаниями. 2 Это достигается за счёт поступления органических веществ одновременно с суши и моря, а также за счёт эффективного использования энергии света фитопланктоном (из-за небольших глубин в эстуарии попадает много света). 4
• Служат убежищами для многих видов, способных жить в солоноватой, то есть разбавленной морской воде. 2 Например, устрицы спасаются здесь от хищников — морских звёзд и моллюска под названием устричное свёрло, которые не переносят низкой солёности. 2
• Снабжают питательными веществами другие морские экосистемы. 2 Здесь в изобилии развиваются болотные растения и микроскопические водоросли. 2 Когда они отмирают, разрушаются волнами, течениями, поедающими их животными и, в конечном итоге, бактериями, то образующиеся при этом растворимые органические вещества и мелкие частицы детрита выносятся в прибрежную зону открытого моря, где становятся пищей для прочих морских организмов — от одноклеточных простейших до червей, моллюсков и рыб. 2
• Служат барьером на пути поступления загрязнений в прибрежную зону моря. 5 Это происходит благодаря работе маргинального фильтра. 5