Эпистаз важен в эволюционной биологии и генетике, потому что он влияет на скорость и возможные направления молекулярной эволюции. 1

В эволюционной биологии эпистаз определяет пути эволюционных изменений. 1 Адаптивные свойства (положительные или отрицательные) каждой новой мутации зависят от того, какие мутации уже успел накопить геном. 1 В случае одной «мутационной истории» одна и та же мутация может иметь положительный адаптивный характер (и тогда она с высокой вероятностью будет закреплена отбором), а в случае другого набора предыдущих мутаций эта же мутация станет отрицательной (и с высокой вероятностью будет элиминирована отбором). 1 Таким образом, под влиянием эпистаза эволюционные изменения могут идти только по определённому набору направлений, а мутации «не соответствующие» этим направлениям будут элиминироваться. 1

В генетике эпистаз позволяет проследить закономерности наследования генов и продемонстрировать особенности их взаимодействия внутри генотипа. 5 Например, любая мутация, нейтральная или положительная в одном генетическом окружении, может оказаться отрицательной (вредной для носителя) в другом. 1