Эмерджентные свойства сложно предсказать и объяснить по нескольким причинам:

• Невозможность однозначно определить последовательность постепенных изменений и пороговую точку. 2 Для уже случившихся эмерджентных событий часто не удаётся найти и однозначно определить, как они возникли. 2
• Отсутствие общепринятых математических моделей. 1 Пока ещё нет математических моделей, которые бы универсально охватывали, описывали и предсказывали возникновение эмерджентных эффектов в различных сложных системах. 1
• Метафизическая несводимость эмерджентных свойств. 3 Даже при полном знании агрегатов и свойств более низкого уровня невозможно предсказать, что может возникнуть из конкретной структуры более низкого уровня с определёнными свойствами. 3

Например, сознание, как яркий пример сильной эмерджентности, возникает из организации мозга, но не может быть полностью сведено к его физическим процессам. 4