Доминирование признаков бывает неполным из-за взаимодействия аллелей. 2 При таком явлении слабый рецессивный признак подавляется сильным доминантным не полностью. 2 В итоге возникает третий фенотип, содержащий признаки доминирующих и рецессивных фенотипов (промежуточный признак). 2
На молекулярном уровне неполное доминирование может объясняться двукратным снижением активности фермента или другого белка. 1 Например, за белую окраску может отвечать дефектный аллель, который даёт неактивный фермент, а за красную — нормальный аллель, который даёт фермент, производящий красный пигмент. 1 При половинной активности этого фермента у гетерозигот количество красного пигмента снижается вдвое, и окраска розовая. 1