Доменная структура характерна для белков, которые взаимодействуют с другими белками, потому что она облегчает взаимодействие. 4

Домены отделены друг от друга неструктурированными фрагментами полипептидной цепи (шарнирными участками). 4 Благодаря этому они могут перемещаться относительно друг друга при взаимодействии. 4 Такое свойство облегчает взаимодействие, а также способно обратимо менять конформацию белковой молекулы и её функциональное состояние. 4

Кроме того, очень часто между доменами располагаются центры связывания с лигандами — соединениями, с которыми избирательно взаимодействует данный белок. 3 При взаимодействии такого белка с лигандом последний чаще всего располагается между доменами. 3

Таким образом, доменная структура позволяет белкам выполнять различные функции, связываясь с разными лигандами и взаимодействуя с ними. 34