ДНК заряжается отрицательно из-за наличия фосфатной группы в составе каждого нуклеотида (пентоза + азотистое основание + фосфат). 1

При образовании фосфодиэфирной связи фосфатные группы сохраняют один из двух отрицательных зарядов, другой теряется при образовании другой сложноэфирной связи с новой пентозой. 1

Это свойство важно для взаимодействия ДНК с другими молекулами, например с белками, которые благодаря отрицательному заряду ДНК могут связываться с ней. 14