Для анализа клеток на наличие Х-хроматина рекомендуется использовать тонкие срезы тканей, потому что в более толстых участках Х-хроматин может быть незаметен из-за сильного свечения всего фрагмента ткани. 1

Также анализ на разъединённых, распластанных клетках проводят, когда невозможно получить мазки или препараты-отпечатки среза органа. 23