Дизентерийная амеба распространена в прудах и озёрах, вероятно, из-за благоприятных условий обитания: таких водоёмов со стоячей водой, где есть много бактерий. 3

Особенно много амеб может быть в водоёмах, образованных сбросами электростанций и загрязнённых сточными водами: большое количество органических веществ и высокая температура воды (от 28 °C и выше) способствуют увеличению популяций амеб. 2