Диаграмма рассеивания не всегда позволяет точно определить причинно-следственные связи между переменными, потому что механизм связи может быть сложным. 1 Часто величины связаны косвенно. 1 Например, рассматривая пару «Длина прыжка — время забега», нельзя сказать, что школьник дальше прыгает потому, что быстрее бегает или наоборот. 1 Общее физическое развитие, рост, тренированность обуславливают обе величины. 1
Также существует риск ложной корреляции. 25 Если между двумя исследуемыми величинами установлена тесная зависимость, то из этого ещё не следует их причинная взаимообусловленность. 5 За счёт эффектов одновременного влияния неучтенных факторов смысл истинной связи может искажаться. 5