Дафнии считаются важным звеном в экосистемах пресных водоёмов по нескольким причинам:

• Роль в пищевых цепях. 5 Дафнии поедают водоросли и служат кормом для многих рыб и других хищников. 5
• Фильтрационная деятельность. 15 Дафнии очищают воду от частиц отмершей органики и избытка фитопланктона, не давая водоёмам «цвести». 5
• Контроль численности микроорганизмов. 1 Определённые виды дафний способны регулировать развитие цианобактерий, выделяющих токсины. 5
• Индикация качества воды. 5 Дафнии чувствительны к чистоте воды и могут служить индикатором отсутствия загрязнений. 3 Их гибель или морфологические изменения сигнализируют об экологических проблемах в водоёме. 5