Цвет зёрен кукурузы может варьироваться от белого до почти чёрного из-за генетических факторов. 2

Окраска семян кукурузы складывается из окраски семенной кожуры (ткань материнского растения), цвета алейронового слоя (ткань триплоидного эндосперма) и собственно ткани триплоидного эндосперма. 1

Некоторые закономерности наследования окраски зёрен:

• Белая окраска обусловлена всеми рецессивными (нефункциональными) аллелями обоих генов, то есть генотипом hh ll. 2
• Розовая окраска — присутствием одного доминантного аллеля любого из генов: Hh ll или hh Ll. 2
• Красная окраска — двумя доминантными аллелями: HH ll, Hh Ll или hh LL. 2
• Тёмно-красная окраска — три аллеля должны быть доминантными, и один — рецессивным: HH Ll, или Hh LL. 2
• Почти чёрная окраска возникает, когда все четыре аллеля доминантны: HH LL. 2

Кроме того, один початок может иметь зёрна разного цвета, если пестики из одного соцветия опыляются пыльцой «цветных» кукуруз. 3