Цианобактерии считаются одними из первых прокариотов, потому что они наиболее близки к древнейшим микроорганизмам, постройки которых (строматолиты) обнаружены на Земле, их возраст — более 3,5 млрд лет. 34

Цианобактерии относятся к наиболее сложно организованным и морфологически дифференцированным прокариотам. 3 Строение их клеточной стенки, отсутствие ядра и многие другие молекулярные параметры говорят о том, что они являются прокариотами. 5

Кроме того, это единственные бактерии, способные к оксигенному фотосинтезу. 34 Благодаря цианобактериям атмосфера Земли приобрела кислород, что позволило развиться аэробной (зависимой от кислорода) жизни. 4