Несколько причин, по которым уменьшается численность чесночницы обыкновенной в Подмосковье:

• Сокращение числа и ухудшение качества водоёмов, пригодных для размножения и развития головастиков. 2
• Увеличение числа наземных и водных хищников, в том числе интродуцированного ротана-головешки. 2
• Фрагментация мест обитания при прокладке дорог, трубопроводов и строительстве населённых пунктов. 2
• Гибель под колёсами транспорта и в техногенных ловушках (люки, ливнестоки, канавы и т. п.). 2
• Скудность кормовой базы в населённых пунктах: в первую очередь, это касается различных насекомых (муравьёв, жуков) и моллюсков. 2
• Отлов головастиков для содержания в террариумах (они нередко становятся жертвами детского вандализма). 2

Также на численность чесночницы влияет длительный период развития её потомства и загрязнение окружающей среды. 1