Несколько причин, по которым черноморский калкан стал редкой рыбой в Чёрном море:

• Интенсивный вылов. 23 Численность популяции была подорвана применением донных тралов, неучтённым выловом браконьеров и незаявленным приловом при неспециализированном промысле. 2
• Ухудшение экологической обстановки. 2 Калкан чувствителен к загрязнению воды, что также влияет на его численность. 4
• Низкая выживаемость икры и личинок. 4 За нерестовый сезон самка калкана может выметать от 1 до 12 миллионов икринок, но выживаемость икры и личинок очень низкая. 4

Для восстановления популяции в разных странах используют разные методы, например, выращивают малька и выпускают его в море с целью пополнения популяции (как это делают в Турции). 4