Ценогенез важен для понимания эволюции, потому что он вносит в эмбриональное развитие характеристики или структуры, не присутствующие ранее в истории эволюции вида или более крупной систематической группы. 3

Такие приспособления организма возникают на стадии зародыша (плода) или личинки и не сохраняются у взрослой особи. 2 Например, к ценогенезам относится плацента млекопитающих, обеспечивающая у плода дыхание, питание и выделение. 2

Наличие ценогенезов — одна из причин нарушений принципа рекапитуляции, лежащего в основе биогенетического закона Эрнста Геккеля. 3 Это не позволяет проследить в ходе онтогенеза современных форм последовательность этапов филогенеза их предков. 2

Таким образом, ценогенез помогает понять, как эволюция происходит путём изменения всего онтогенетического цикла в каждом очередном поколении, а не за счёт прибавления конечных стадий. 4