Однозначного объяснения, почему Большое Красное Пятно (БКП) меняет свой цвет на протяжении веков, нет. 1

По одной из гипотез, пока ураган находится на одинаковой высоте с общей поверхностью верхнего края атмосферы, он имеет белый цвет. 1 Но когда его мощность увеличивается, вихрь поднимается несколько выше общего слоя облаков, где ультрафиолетовое излучение Солнца химически изменяет цвет, придавая ему красноту. 1

Также есть версия, что с 2014 года БКП становится темнее при наблюдениях на длинах волн короче 650 нанометров, то есть вихрь стал более оранжевым, при этом его тёмное ядро уменьшилось в размерах. 4 Это может быть связано с увеличением потока ультрафиолетового излучения на больших высотах, который, взаимодействуя с химическими веществами в облаках, даёт более насыщенный цвет. 4