Большинство учёных придерживаются органической (биогенной) теории происхождения нефти по нескольким причинам:

• Доказательства расположения месторождений. 5 Большинство газовых и нефтяных месторождений расположены в осадочных горных породах, которые образовались из донных отложений древних водных бассейнов, в которых развивалась жизнь. 5
• Наличие элементов органического происхождения. 5 В составе природной нефти зафиксировано наличие таких элементов. 5
• Сходство живой материи и нефти по элементному и изотопному составу. 1 В большинстве нефтяных месторождений обнаруживаются биомаркеры, например пигменты хлорофилла — вещества из листьев живого растения. 1
• Результаты лабораторных экспериментов. 14 В лабораторных условиях с помощью сильного повышения температуры удалось воспроизвести процесс превращения керогена в нефть всего за несколько часов. 4

Однако единой теории происхождения нефти учёные до сих пор не достигли. 34 Есть и другие гипотезы, например, неорганическая (абиогенная), согласно которой углеводороды образовались из углекислого газа и воды. 1 Некоторые учёные склонны верить, что как органические, так и неорганические процессы могут совместно синтезировать нефть. 4