Бластоциста становится возможной ключевой стадией в эволюции млекопитающих, потому что она возникла для обеспечения имплантации (прикрепления эмбриона к стенке матки) и для организации пространственной основы формирования зародышевого диска при отсутствии желтка. 12

Имплантация имеет решающее значение для выживания и развития раннего эмбриона, она устанавливает связь между матерью и ранним эмбрионом, которая будет продолжаться до конца беременности. 1 Структурные изменения как в бластоцисте, так и в стенке эндометрия делают её возможной: высвобождаемые ферменты разрушают слизистую оболочку эндометрия, а аутокринные факторы роста позволяют бластоцисте в дальнейшем проникать в эндометрий. 1

Кроме того, эволюционная роль бластоцисты состоит в формировании шарообразной структуры, имитирующей развитие эмбриона на желтке у яйцекладущих предков млекопитающих. 5