BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) считается важным инструментом в биоинформатике благодаря своей способности быстро искать и сравнивать последовательности с большими базами данных, выявляя похожие области и потенциальные функциональные связи. 2
Некоторые причины, по которым BLAST полезен:
- Идентификация видов. 1 С помощью BLAST можно правильно идентифицировать вид или найти гомологичные виды. 1 Это полезно, например, при работе с последовательностью ДНК неизвестного вида. 1
- Поиск доменов. 1 Последовательность белка можно ввести в BLAST, чтобы локализовать известные домены внутри интересующей последовательности. 1
- Установление филогении. 1 Используя результаты, полученные с помощью BLAST, можно создать филогенетическое дерево. 1
- Картирование ДНК. 1 При работе с известным видом и поиске последовательности гена в неизвестном местоположении BLAST может сравнить хромосомное положение интересующей последовательности с соответствующими последовательностями в базах данных. 1
- Сравнение. 1 При работе с генами BLAST может находить общие гены у двух родственных видов и использоваться для сопоставления аннотаций от одного организма к другому. 1
Кроме того, BLAST помог демократизировать биоинформатический анализ и сделать его доступным для любого исследователя через Интернет. 1