Бесполовое размножение у инфузорий не всегда даёт генетически однородное потомство, потому что в процессе деления наследственный материал распределяется по двум дочерним клеткам не поровну. 3 Таким образом, наследственная информация передаётся от одной клетки всем её потомкам не без потерь. 3

Для повышения генетического разнообразия вида у инфузорий существует половой процесс — конъюгация. 34 Во время него две инфузории обмениваются малыми ядрами: одно из ядер каждой особи перетекает в другую клетку и там сливается с оставшимся ядром. 3 Таким образом осуществляется обмен наследственной (генетической) информацией. 3

Кроме того, при формировании макронуклеуса — ядра, обеспечивающего повседневную жизнь инфузории, часть гена, отвечающего за принадлежность к определённому типу спаривания, похожа на транспозоны — последовательности-паразиты, способные случайным образом расселяться по геному. 5 Наличие такой посторонней последовательности внутри гена приводит к нарушению его функции. 5 У инфузорий есть специальные механизмы, с помощью которых удаляются транспозоноподобные последовательности. 5